有效保护自己的核心在于主动构筑并维持稳固的防线，这首先需要利用游戏内置的保护机制。玩家可以通过使用特定的道具立刻进入免战状态，在一段时间内使自己的基地免受攻击，这一策略在离线前或资源储备关键期尤为重要。需保护状态通常有持续时间限制，并可被特定条件或更高权限的战争行为解除，因此合理规划保护时间的用途至关重要，玩家应在此期间专注于资源积累、军队整备或科技研发，为保护状态结束后的潜在冲突做好充分准备。
除了依赖系统保护，设计周密的防御体系是长期安全的基石。这要求玩家在城市建设初期就进行合理规划，优先升级如城墙和指挥部等级，并围绕着城市核心区域布置如炮台和防空炮等防御设施，形成多层防护网。城市内部的布局也需深思熟虑，例如将资源生产建筑密集置于内圈以减少被侦察发现的概率，而将陆军基地和空军基地等军事建筑靠近核心区以确保部队能快速响应突发攻击。在没有保护罩覆盖时，这些提前建立的防御设施将成为抵御入侵的第一道防线。
参与一个活跃的联盟是获得集体安全保障的关键举措。联盟成员之间可以互相提供支援，不仅能够在战时派遣部队协助防守城市，还能进行资源援助以应对突发危机。联盟本身作为一个作战指挥部，其成员可以共享情报、协调战术并共同建设如军团城市这样的战略支点。在军团城市中，成员可通过贡献资源来生产超越个人城市能力的高级军备，并通过军需部快速调配这些补给，从而整体提升联盟集群的防御和作战能力，使得个人城市的安全与联盟的兴衰紧密关联。
部队的日常部署与管理同样是防护的重要环节。玩家的作战单位不应长时间暴露在野外，尤其是在预料可能遭遇攻击时，应将主力部队集中于城市周边待命。空军单位需要妥善停放在机场，否则会因缺乏补给而自然损耗；海军单位则应驻泊于海港。提前在关键区域部署如轻型坦克和摩托化步兵这类机动部队，可以让他们在需要时快速支援受威胁的区域。派遣侦察单位进行定期巡逻以监控敌方动向，能够为调整防御部署争取到宝贵的预警时间。
从整体战略层面考量，保护措施与进攻准备是相辅相成的。培养高星级的军官，并注重其后勤与军事属性的平衡，能显著增强部队的攻防实力。在科技研发路线上，优先选择能够提升部队防御值或缩短建筑修复时间的防御类项目，可以系统性强化生存能力。资源管理策略也需审慎，保持资源产量与消耗的动态平衡，避免因囤积过量资源而成为被攻击的目标，适时的资源捐献或转移也是降低风险的明智选择。有效的保护是一个涵盖机制利用、设施建设、联盟协作、部队管理与宏观策略的综合课题。
