获取S级忍者是玩家提升战力的核心追求，其途径多样，主要可分为直接招募、活动兑换以及碎片收集等几种方式。最核心且稳定的途径是通过游戏内的高级招募系统进行抽取，这是强力S忍者的主要产出渠道。该系统会周期性更新高招S忍，通常每四个月进行一次轮换，因此玩家需要提前规划，长期且有纪律地积攒招募所需的金币和高招券。在每次新高招S忍上架时，游戏往往会同步开启首付活动，玩家在活动期间投入规定额度的金币进行抽取，即可额外兑换大量该忍者的碎片与其它奖励，这为完整招募奠定了重要基础。进行高级招募时，通常会建议玩家储备足够的资源以达成保底次数，从而稳定获得目标忍者。
除了常规的高级招募，积极参与各类游戏内限时活动是获取S级忍者及其碎片的高效途径。例如巅峰对决这类特殊玩法，其对玩家的战力要求相对较低，主要依靠策略参与，通过参与竞猜、使用活动产出的幸运结等道具进行兑换，即可较为稳定地获得指定S忍的碎片。诸如许愿宝库、幸运夺宝等活动也会定期开放，玩家可以利用平时积累的金币在这些活动中抽取过往的强力S忍或A忍整卡。特权商店对于达到一定VIP等级的玩家而言也是一个直接渠道，V7及以上的玩家可以在其中直接购买部分特定S级忍者的碎片，这为补充碎片提供了稳定来源。
依托于玩家组织或社群的协作是获取部分特定S级忍者的关键。加入一个活跃且管理有序的组织至关重要，通过参与要塞争夺战、跨服要塞等组织活动，可以获得专属的货币奖励。这些货币可以在组织商店中兑换如纲手、仙人自来也等S忍的碎片。组织内的祈愿功能允许成员之间互相捐赠多余的忍者碎片，这能有效加快特定忍者的收集进度。部分S忍如猿飞日斩的获取，更是直接与组织在组织争霸赛中的排名和战绩挂钩，凸显了团队协作的重要性。寻找并融入一个强大的组织，是获取这些组织专属S忍的必要前提。
通过持之以恒的日常活跃与碎片化积累来合成S忍，是一条虽慢但切实可行的道路。这要求玩家保持较高的游戏活跃度，每日完成所有日常任务、决斗场任务并达成活跃度目标，以稳定获取金币。积极参与游戏内各种有金币或忍者碎片奖励的限时活动。通过持续挑战生存挑战、刷取特定精英副本等方式，也能逐步收集到某些S忍的碎片。虽然这种方式耗时较长，需要玩家具备耐心和长期的游戏规划，但确实能在不依赖大量金币直接抽取的情况下，通过点滴积累最终合成出强力的S级忍者。
游戏内还存在一些较为特殊或高端的S忍获取机制，通常与玩家的长期投入或特定成就绑定。当玩家将任意一名忍者培养至五星后，会解锁一个特殊的商店，可以将五星忍者溢出的碎片转化为稀有货币，用以兑换如大蛇丸等S忍的碎片。另一种情况是参与玉石商店或类似的高阶兑换系统，这同样需要玩家在游戏中达到一定的养成深度。这些方式通常不作为新手的首选，但为长期坚持游戏的玩家提供了将日常养成资源最终转化为顶级战力的通道，属于游戏终局内容的一部分。
